現代農業的快速發展加快推進農業新興產業的發展，但實現農業現代化的過程還存在不少制約因素。

農業本身是“露天工廠”，農業生產過程中對自然環境和生長因子的控制水平不高，農業生產風險的不確定性和動物疫情的突發性難以掌控，農產品價格不確定，農民受益不穩定。農業化發展水平還不適應現代市場經濟的要求，以高新技術應用為主的農業高效規模化水平不高，農業組織化還處于初級階段，農業總體上的生產還未有根本改變，農業生產還未形成產前、產中、產后全過程的緊密連接，一級生產、流通、消費相互銜接的現代農業產業體系。

農業信息化水平不高，信息技術在農業生產、流通、管理、監控等各個環節的應用不夠廣泛，缺少典型示范。智慧農業在現代農業中的顯示度不高，嚴重影響了農業資源的利用率和生產效率的提高。

農業生態環境越來越突出，農村資源污染治理壓力大，傳統農業生產方式和管理模式已難以為農產品的質量與安全提供可靠保障，農業的功能單一，其生產功能、文化功能、生態功能、休閑功能等綜合功能未協調發展起來。農業服務產業化水平不高，農業外延功能潛力還有待打理挖掘和開發利用，還需大力提高農業品牌效應、區域特色和綜合競爭力。