先進的漁業工程與裝備是漁業發展水平的重要體現，中國漁業與發達國家間的差距主要體現在工程與裝備相對落后未來的先進漁業工程與裝備主要針對遠洋與極地漁業資源開發、深遠海養殖空間拓展、海洋生物資源養護和近海養殖產業提升等漁業轉型發展的重大需求，進一步提升漁業開發領域、作業效率和可持續發展的能力，在遠洋漁業和南極磷蝦資源開發領域，精準快捷的魚群探測和漁場預測技術、高效節能的捕撈技術和基于生態系統的漁業資源可持續利用與管理是目前開發大洋性公海海域漁業資源的方向。因此加速提升中國作業漁船的自身性能、漁業資源探捕設施及加工裝備是大力發展遠洋和極地漁業迫切需求。

在水產養殖領域，拓展深遠海養殖和發展陸基循環水養殖將成為未來海水養殖可持續發展的戰略選擇。深遠海養殖首先要以先進的設施和工程裝備為基礎。由于深遠海養殖是一項多學科、多產業交叉的綜合性系統工程，包括現代工業、電子信息、海洋工程、生物技術等綜合技術集成和應用。在這些技術的支撐下，能夠確保深海養殖過程得到有效管控，信息化完全，自動化和機械化水平高。

目前，深海抗風浪網箱、大型養殖平臺和海上養殖工船是目前世界各國拓展深遠海養殖的三大主體模式，養殖水域深海化、養殖設施大型化、養殖操作自動化、生產管理信息化是深海養殖工程與科技發展的主要趨勢，也是今后拓展海水養殖新空間的重要發展方向。工廠化養殖是陸基循環水養殖的先進模式，它可以避免開放式養殖帶來的環境問題，隨著工業化水平的不斷提高，工廠化循環水養殖成為未來養殖發展的必然選擇。